知識產權海關保護，是指當發現貨物侵犯知識產權時，海關依法采取的禁止貨物進出口的保護措施。在世界貿易組織《與貿易有關的知識產權協議》中被稱為知識產權“邊境措施”。

     知識產權海關保護有依申請的保護和依職權的保護兩種模式。

    （一）依申請保護。指知識產權權利人發現侵權嫌疑貨物即將進出口后向海關提出申請，海關根據知識產權權利人的申請扣留侵權嫌疑貨物。依申請保護模式又被稱為“被動保護”模式，因為在這一模式下，海關不會主動采取制止侵權嫌疑貨物進出口的措施。

    （二）依職權保護。指海關在對進出口貨物的監管過程中，若發現進出口貨物涉嫌侵犯已在海關總署備案的知識產權的，將主動采取扣留和調查處理措施。由于在依職權保護模式下，海關有權主動采取制止侵權貨物進出口的措施，因此這一模式又被稱作“主動保護”模式。應當注意的是，依職權保護模式僅適用于知識產權權利人事先將其知識產權向海關總署備案的情形。